Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAK2O60296 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAK2O60296 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAK2O60296 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAK2O60296 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAK2O60296 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAK2O60296 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAK2O60296 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAK2O60296 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAK2O60296 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAK2O60296 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAK2O60296 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAK2O60296 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAK2O60296 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAK2O60296 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAK2O60296 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAK2O60296 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAK2O60296 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAK2O60296 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAK2O60296 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAK2O60296 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAK2O60296 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAK2O60296 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAK2O60296 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAK2O60296 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAK2O60296 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAK2O60296 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAK2O60296 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAK2O60296 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAK2O60296 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAK2O60296 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAK2O60296 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAK2O60296 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAK2O60296 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAK2O60296 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAK2O60296 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAK2O60296 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAK2O60296 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAK2O60296 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAK2O60296 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAK2O60296 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAK2O60296 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAK2O60296 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAK2O60296 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAK2O60296 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAK2O60296 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAK2O60296 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAK2O60296 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms