Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EXTL3O43909 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EXTL3O43909 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms