Protein–RNA interactions for Protein: O43896

KIF1C, Kinesin-like protein KIF1C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF1CO43896 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
KIF1CO43896 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KIF1CO43896 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
KIF1CO43896 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KIF1CO43896 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KIF1CO43896 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KIF1CO43896 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KIF1CO43896 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KIF1CO43896 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KIF1CO43896 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
KIF1CO43896 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
KIF1CO43896 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KIF1CO43896 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
KIF1CO43896 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
KIF1CO43896 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
KIF1CO43896 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KIF1CO43896 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KIF1CO43896 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KIF1CO43896 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KIF1CO43896 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms