Protein–RNA interactions for Protein: O43815

STRN, Striatin, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRNO43815 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
STRNO43815 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRNO43815 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRNO43815 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRNO43815 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRNO43815 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRNO43815 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRNO43815 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRNO43815 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRNO43815 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRNO43815 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRNO43815 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRNO43815 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRNO43815 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRNO43815 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRNO43815 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRNO43815 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRNO43815 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRNO43815 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRNO43815 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRNO43815 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRNO43815 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRNO43815 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRNO43815 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRNO43815 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRNO43815 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRNO43815 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
STRNO43815 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRNO43815 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRNO43815 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRNO43815 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRNO43815 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRNO43815 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRNO43815 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRNO43815 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRNO43815 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRNO43815 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
STRNO43815 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
STRNO43815 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
STRNO43815 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRNO43815 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRNO43815 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRNO43815 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
STRNO43815 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
STRNO43815 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
STRNO43815 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
STRNO43815 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
STRNO43815 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
STRNO43815 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
STRNO43815 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
STRNO43815 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
STRNO43815 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRNO43815 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
STRNO43815 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRNO43815 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRNO43815 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
STRNO43815 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRNO43815 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRNO43815 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRNO43815 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRNO43815 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRNO43815 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRNO43815 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
STRNO43815 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRNO43815 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
STRNO43815 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRNO43815 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRNO43815 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRNO43815 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRNO43815 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRNO43815 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRNO43815 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRNO43815 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRNO43815 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRNO43815 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
STRNO43815 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRNO43815 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRNO43815 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRNO43815 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRNO43815 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRNO43815 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRNO43815 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRNO43815 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRNO43815 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRNO43815 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRNO43815 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRNO43815 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRNO43815 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRNO43815 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
STRNO43815 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
STRNO43815 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
STRNO43815 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
STRNO43815 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
STRNO43815 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
STRNO43815 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
STRNO43815 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
STRNO43815 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
STRNO43815 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
STRNO43815 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
STRNO43815 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms