Protein–RNA interactions for Protein: O43813

LANCL1, LanC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LANCL1O43813 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LANCL1O43813 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LANCL1O43813 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LANCL1O43813 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LANCL1O43813 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LANCL1O43813 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LANCL1O43813 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LANCL1O43813 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LANCL1O43813 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LANCL1O43813 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LANCL1O43813 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LANCL1O43813 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LANCL1O43813 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LANCL1O43813 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LANCL1O43813 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LANCL1O43813 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LANCL1O43813 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LANCL1O43813 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LANCL1O43813 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LANCL1O43813 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LANCL1O43813 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LANCL1O43813 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LANCL1O43813 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LANCL1O43813 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LANCL1O43813 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LANCL1O43813 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LANCL1O43813 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LANCL1O43813 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LANCL1O43813 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LANCL1O43813 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LANCL1O43813 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LANCL1O43813 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LANCL1O43813 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LANCL1O43813 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LANCL1O43813 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LANCL1O43813 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LANCL1O43813 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LANCL1O43813 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LANCL1O43813 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LANCL1O43813 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LANCL1O43813 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LANCL1O43813 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LANCL1O43813 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LANCL1O43813 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LANCL1O43813 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LANCL1O43813 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LANCL1O43813 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LANCL1O43813 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LANCL1O43813 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LANCL1O43813 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LANCL1O43813 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LANCL1O43813 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LANCL1O43813 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LANCL1O43813 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LANCL1O43813 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LANCL1O43813 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LANCL1O43813 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LANCL1O43813 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LANCL1O43813 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LANCL1O43813 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LANCL1O43813 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LANCL1O43813 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LANCL1O43813 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
LANCL1O43813 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LANCL1O43813 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
LANCL1O43813 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LANCL1O43813 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LANCL1O43813 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LANCL1O43813 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LANCL1O43813 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LANCL1O43813 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LANCL1O43813 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
LANCL1O43813 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
LANCL1O43813 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
LANCL1O43813 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
LANCL1O43813 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LANCL1O43813 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LANCL1O43813 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LANCL1O43813 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LANCL1O43813 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LANCL1O43813 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LANCL1O43813 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LANCL1O43813 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LANCL1O43813 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LANCL1O43813 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LANCL1O43813 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LANCL1O43813 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LANCL1O43813 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LANCL1O43813 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LANCL1O43813 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LANCL1O43813 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LANCL1O43813 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LANCL1O43813 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LANCL1O43813 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LANCL1O43813 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LANCL1O43813 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LANCL1O43813 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LANCL1O43813 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
LANCL1O43813 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LANCL1O43813 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms