Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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