Protein–RNA interactions for Protein: O43237

DYNC1LI2, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI2O43237 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DYNC1LI2O43237 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DYNC1LI2O43237 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DYNC1LI2O43237 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DYNC1LI2O43237 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DYNC1LI2O43237 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DYNC1LI2O43237 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DYNC1LI2O43237 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DYNC1LI2O43237 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DYNC1LI2O43237 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DYNC1LI2O43237 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DYNC1LI2O43237 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DYNC1LI2O43237 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DYNC1LI2O43237 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
DYNC1LI2O43237 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DYNC1LI2O43237 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DYNC1LI2O43237 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DYNC1LI2O43237 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DYNC1LI2O43237 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DYNC1LI2O43237 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DYNC1LI2O43237 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DYNC1LI2O43237 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DYNC1LI2O43237 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DYNC1LI2O43237 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DYNC1LI2O43237 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DYNC1LI2O43237 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DYNC1LI2O43237 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DYNC1LI2O43237 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DYNC1LI2O43237 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DYNC1LI2O43237 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DYNC1LI2O43237 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DYNC1LI2O43237 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DYNC1LI2O43237 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DYNC1LI2O43237 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DYNC1LI2O43237 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DYNC1LI2O43237 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DYNC1LI2O43237 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DYNC1LI2O43237 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DYNC1LI2O43237 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DYNC1LI2O43237 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DYNC1LI2O43237 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DYNC1LI2O43237 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DYNC1LI2O43237 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DYNC1LI2O43237 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DYNC1LI2O43237 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DYNC1LI2O43237 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DYNC1LI2O43237 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DYNC1LI2O43237 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DYNC1LI2O43237 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DYNC1LI2O43237 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DYNC1LI2O43237 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DYNC1LI2O43237 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DYNC1LI2O43237 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DYNC1LI2O43237 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DYNC1LI2O43237 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DYNC1LI2O43237 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DYNC1LI2O43237 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DYNC1LI2O43237 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DYNC1LI2O43237 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DYNC1LI2O43237 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DYNC1LI2O43237 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DYNC1LI2O43237 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
DYNC1LI2O43237 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DYNC1LI2O43237 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
DYNC1LI2O43237 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DYNC1LI2O43237 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DYNC1LI2O43237 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DYNC1LI2O43237 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms