Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC27A2O14975 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC27A2O14975 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC27A2O14975 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC27A2O14975 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC27A2O14975 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC27A2O14975 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC27A2O14975 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC27A2O14975 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC27A2O14975 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC27A2O14975 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC27A2O14975 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC27A2O14975 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC27A2O14975 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC27A2O14975 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC27A2O14975 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC27A2O14975 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC27A2O14975 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC27A2O14975 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC27A2O14975 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC27A2O14975 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC27A2O14975 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC27A2O14975 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC27A2O14975 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC27A2O14975 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC27A2O14975 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC27A2O14975 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC27A2O14975 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC27A2O14975 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC27A2O14975 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC27A2O14975 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC27A2O14975 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC27A2O14975 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC27A2O14975 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC27A2O14975 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC27A2O14975 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC27A2O14975 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC27A2O14975 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC27A2O14975 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC27A2O14975 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms