Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLRMTO00411 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLRMTO00411 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLRMTO00411 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLRMTO00411 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLRMTO00411 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLRMTO00411 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLRMTO00411 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLRMTO00411 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLRMTO00411 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLRMTO00411 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLRMTO00411 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
POLRMTO00411 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLRMTO00411 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLRMTO00411 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLRMTO00411 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
POLRMTO00411 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLRMTO00411 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLRMTO00411 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLRMTO00411 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLRMTO00411 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
POLRMTO00411 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLRMTO00411 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLRMTO00411 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
POLRMTO00411 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLRMTO00411 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLRMTO00411 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLRMTO00411 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLRMTO00411 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLRMTO00411 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
POLRMTO00411 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLRMTO00411 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLRMTO00411 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLRMTO00411 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLRMTO00411 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLRMTO00411 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
POLRMTO00411 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLRMTO00411 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLRMTO00411 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLRMTO00411 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLRMTO00411 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLRMTO00411 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLRMTO00411 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLRMTO00411 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLRMTO00411 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLRMTO00411 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
POLRMTO00411 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
POLRMTO00411 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
POLRMTO00411 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
POLRMTO00411 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
POLRMTO00411 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
POLRMTO00411 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
POLRMTO00411 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
POLRMTO00411 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLRMTO00411 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLRMTO00411 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
POLRMTO00411 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLRMTO00411 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLRMTO00411 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLRMTO00411 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLRMTO00411 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLRMTO00411 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLRMTO00411 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLRMTO00411 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLRMTO00411 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLRMTO00411 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLRMTO00411 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLRMTO00411 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLRMTO00411 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLRMTO00411 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLRMTO00411 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLRMTO00411 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLRMTO00411 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLRMTO00411 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLRMTO00411 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
POLRMTO00411 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLRMTO00411 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLRMTO00411 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLRMTO00411 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLRMTO00411 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLRMTO00411 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLRMTO00411 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLRMTO00411 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLRMTO00411 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLRMTO00411 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLRMTO00411 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLRMTO00411 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLRMTO00411 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
POLRMTO00411 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
POLRMTO00411 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLRMTO00411 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
POLRMTO00411 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLRMTO00411 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLRMTO00411 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLRMTO00411 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLRMTO00411 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
POLRMTO00411 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLRMTO00411 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLRMTO00411 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLRMTO00411 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms