Protein–RNA interactions for Protein: O00148

DDX39A, ATP-dependent RNA helicase DDX39A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39AO00148 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX39AO00148 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX39AO00148 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX39AO00148 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX39AO00148 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX39AO00148 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX39AO00148 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX39AO00148 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX39AO00148 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX39AO00148 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX39AO00148 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX39AO00148 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX39AO00148 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX39AO00148 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX39AO00148 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX39AO00148 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX39AO00148 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX39AO00148 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX39AO00148 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX39AO00148 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX39AO00148 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX39AO00148 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX39AO00148 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX39AO00148 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX39AO00148 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX39AO00148 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX39AO00148 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX39AO00148 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX39AO00148 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX39AO00148 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX39AO00148 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX39AO00148 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX39AO00148 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX39AO00148 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX39AO00148 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX39AO00148 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX39AO00148 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX39AO00148 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX39AO00148 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX39AO00148 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX39AO00148 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX39AO00148 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX39AO00148 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX39AO00148 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX39AO00148 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX39AO00148 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DDX39AO00148 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DDX39AO00148 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DDX39AO00148 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX39AO00148 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX39AO00148 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX39AO00148 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX39AO00148 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX39AO00148 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX39AO00148 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX39AO00148 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX39AO00148 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX39AO00148 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX39AO00148 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX39AO00148 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX39AO00148 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX39AO00148 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX39AO00148 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX39AO00148 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX39AO00148 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX39AO00148 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX39AO00148 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX39AO00148 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX39AO00148 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX39AO00148 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX39AO00148 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX39AO00148 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX39AO00148 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX39AO00148 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX39AO00148 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX39AO00148 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX39AO00148 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX39AO00148 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX39AO00148 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX39AO00148 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX39AO00148 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX39AO00148 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX39AO00148 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX39AO00148 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX39AO00148 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX39AO00148 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX39AO00148 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX39AO00148 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX39AO00148 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX39AO00148 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX39AO00148 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX39AO00148 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX39AO00148 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX39AO00148 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX39AO00148 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX39AO00148 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX39AO00148 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX39AO00148 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX39AO00148 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX39AO00148 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms