Protein–RNA interactions for Protein: H3BRM9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BRM9 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BRM9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3BRM9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3BRM9 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3BRM9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3BRM9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3BRM9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3BRM9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3BRM9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3BRM9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3BRM9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3BRM9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3BRM9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
H3BRM9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3BRM9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3BRM9 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3BRM9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3BRM9 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3BRM9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3BRM9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H3BRM9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H3BRM9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H3BRM9 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H3BRM9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H3BRM9 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H3BRM9 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H3BRM9 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H3BRM9 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H3BRM9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H3BRM9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
H3BRM9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H3BRM9 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H3BRM9 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H3BRM9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H3BRM9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H3BRM9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H3BRM9 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H3BRM9 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
H3BRM9 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BRM9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BRM9 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BRM9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BRM9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BRM9 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BRM9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BRM9 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BRM9 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BRM9 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BRM9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BRM9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BRM9 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BRM9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BRM9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BRM9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BRM9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BRM9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BRM9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BRM9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BRM9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BRM9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BRM9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BRM9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BRM9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BRM9 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BRM9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BRM9 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BRM9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BRM9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BRM9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BRM9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BRM9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BRM9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BRM9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BRM9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BRM9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BRM9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BRM9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BRM9 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BRM9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BRM9 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BRM9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BRM9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BRM9 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BRM9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BRM9 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BRM9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BRM9 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BRM9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BRM9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BRM9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BRM9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BRM9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BRM9 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BRM9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BRM9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BRM9 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BRM9 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BRM9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BRM9 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BRM9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms