Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms