Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PBE3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PBE3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PBE3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PBE3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PBE3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PBE3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PBE3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PBE3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PBE3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PBE3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PBE3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PBE3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PBE3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PBE3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PBE3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PBE3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PBE3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PBE3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PBE3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PBE3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PBE3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PBE3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PBE3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PBE3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PBE3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PBE3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PBE3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PBE3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PBE3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PBE3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PBE3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PBE3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PBE3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PBE3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
E9PBE3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
E9PBE3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
E9PBE3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
E9PBE3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E9PBE3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
E9PBE3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
E9PBE3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
E9PBE3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E9PBE3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E9PBE3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E9PBE3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
E9PBE3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E9PBE3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
E9PBE3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E9PBE3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
E9PBE3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
E9PBE3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E9PBE3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E9PBE3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
E9PBE3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
E9PBE3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
E9PBE3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E9PBE3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E9PBE3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E9PBE3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E9PBE3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
E9PBE3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
E9PBE3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E9PBE3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
E9PBE3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
E9PBE3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E9PBE3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
E9PBE3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
E9PBE3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E9PBE3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
E9PBE3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
E9PBE3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
E9PBE3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
E9PBE3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
E9PBE3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
E9PBE3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
E9PBE3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
E9PBE3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
E9PBE3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
E9PBE3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
E9PBE3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
E9PBE3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
E9PBE3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
E9PBE3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
E9PBE3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
E9PBE3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
E9PBE3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
E9PBE3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
E9PBE3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
E9PBE3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
E9PBE3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E9PBE3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E9PBE3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E9PBE3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
E9PBE3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
E9PBE3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
E9PBE3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E9PBE3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E9PBE3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
E9PBE3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms