Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CLDN25C9JDP6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CLDN25C9JDP6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CLDN25C9JDP6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CLDN25C9JDP6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CLDN25C9JDP6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CLDN25C9JDP6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CLDN25C9JDP6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CLDN25C9JDP6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CLDN25C9JDP6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CLDN25C9JDP6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CLDN25C9JDP6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CLDN25C9JDP6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CLDN25C9JDP6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CLDN25C9JDP6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CLDN25C9JDP6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CLDN25C9JDP6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CLDN25C9JDP6 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CLDN25C9JDP6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CLDN25C9JDP6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CLDN25C9JDP6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLDN25C9JDP6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CLDN25C9JDP6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLDN25C9JDP6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLDN25C9JDP6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLDN25C9JDP6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLDN25C9JDP6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLDN25C9JDP6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLDN25C9JDP6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLDN25C9JDP6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLDN25C9JDP6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLDN25C9JDP6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLDN25C9JDP6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLDN25C9JDP6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLDN25C9JDP6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLDN25C9JDP6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLDN25C9JDP6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLDN25C9JDP6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLDN25C9JDP6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CLDN25C9JDP6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CLDN25C9JDP6 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CLDN25C9JDP6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CLDN25C9JDP6 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CLDN25C9JDP6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CLDN25C9JDP6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CLDN25C9JDP6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CLDN25C9JDP6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CLDN25C9JDP6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CLDN25C9JDP6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CLDN25C9JDP6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CLDN25C9JDP6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CLDN25C9JDP6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CLDN25C9JDP6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CLDN25C9JDP6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CLDN25C9JDP6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CLDN25C9JDP6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CLDN25C9JDP6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CLDN25C9JDP6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CLDN25C9JDP6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CLDN25C9JDP6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CLDN25C9JDP6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CLDN25C9JDP6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CLDN25C9JDP6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CLDN25C9JDP6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CLDN25C9JDP6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CLDN25C9JDP6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CLDN25C9JDP6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CLDN25C9JDP6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CLDN25C9JDP6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CLDN25C9JDP6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CLDN25C9JDP6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CLDN25C9JDP6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CLDN25C9JDP6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CLDN25C9JDP6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CLDN25C9JDP6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CLDN25C9JDP6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CLDN25C9JDP6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CLDN25C9JDP6 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CLDN25C9JDP6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CLDN25C9JDP6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CLDN25C9JDP6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CLDN25C9JDP6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CLDN25C9JDP6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CLDN25C9JDP6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CLDN25C9JDP6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CLDN25C9JDP6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CLDN25C9JDP6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CLDN25C9JDP6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CLDN25C9JDP6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CLDN25C9JDP6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CLDN25C9JDP6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CLDN25C9JDP6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CLDN25C9JDP6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CLDN25C9JDP6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CLDN25C9JDP6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CLDN25C9JDP6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CLDN25C9JDP6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CLDN25C9JDP6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CLDN25C9JDP6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CLDN25C9JDP6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
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