Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms