Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms