Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms