Protein–RNA interactions for Protein: A6NFU0

FAM187A, Ig-like V-type domain-containing protein FAM187A, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187AA6NFU0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM187AA6NFU0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM187AA6NFU0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM187AA6NFU0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM187AA6NFU0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM187AA6NFU0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM187AA6NFU0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM187AA6NFU0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM187AA6NFU0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM187AA6NFU0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM187AA6NFU0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM187AA6NFU0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM187AA6NFU0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM187AA6NFU0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM187AA6NFU0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM187AA6NFU0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM187AA6NFU0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM187AA6NFU0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM187AA6NFU0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM187AA6NFU0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM187AA6NFU0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM187AA6NFU0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM187AA6NFU0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM187AA6NFU0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM187AA6NFU0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM187AA6NFU0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM187AA6NFU0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM187AA6NFU0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM187AA6NFU0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM187AA6NFU0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM187AA6NFU0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM187AA6NFU0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM187AA6NFU0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM187AA6NFU0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM187AA6NFU0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM187AA6NFU0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM187AA6NFU0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM187AA6NFU0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM187AA6NFU0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM187AA6NFU0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM187AA6NFU0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM187AA6NFU0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM187AA6NFU0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM187AA6NFU0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM187AA6NFU0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM187AA6NFU0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM187AA6NFU0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM187AA6NFU0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM187AA6NFU0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM187AA6NFU0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM187AA6NFU0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM187AA6NFU0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM187AA6NFU0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM187AA6NFU0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM187AA6NFU0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM187AA6NFU0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM187AA6NFU0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM187AA6NFU0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM187AA6NFU0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM187AA6NFU0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM187AA6NFU0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM187AA6NFU0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM187AA6NFU0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM187AA6NFU0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM187AA6NFU0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM187AA6NFU0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM187AA6NFU0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM187AA6NFU0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM187AA6NFU0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms