Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms