Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms