Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
XIRP2A4UGR9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
XIRP2A4UGR9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
XIRP2A4UGR9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
XIRP2A4UGR9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
XIRP2A4UGR9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
XIRP2A4UGR9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
XIRP2A4UGR9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
XIRP2A4UGR9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
XIRP2A4UGR9 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
XIRP2A4UGR9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
XIRP2A4UGR9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
XIRP2A4UGR9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
XIRP2A4UGR9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
XIRP2A4UGR9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
XIRP2A4UGR9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
XIRP2A4UGR9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
XIRP2A4UGR9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
XIRP2A4UGR9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
XIRP2A4UGR9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XIRP2A4UGR9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
XIRP2A4UGR9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
XIRP2A4UGR9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XIRP2A4UGR9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XIRP2A4UGR9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms