Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 RBMS1-201ENST00000348849 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 STARD8-203ENST00000374599 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 LPP-AS2-201ENST00000605573 2852 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 AC006037.2-201ENST00000622975 2232 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 IRF5-203ENST00000402030 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 MIS12-206ENST00000611091 2691 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 HDAC7-230ENST00000552960 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 HERC6-201ENST00000264346 3779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 DNAJC9-201ENST00000372950 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 MED24-212ENST00000501516 3037 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 ABL2-202ENST00000367623 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 S100B-201ENST00000291700 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 PRY-201ENST00000303728 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 PRY2-201ENST00000303804 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 HIST1H1E-201ENST00000304218 754 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 PRYP3-201ENST00000343584 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 AREG-201ENST00000395748 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 AC010997.3-201ENST00000418818 502 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 IQCJ-202ENST00000451172 885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 RN7SL43P-201ENST00000463926 291 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 RN7SL838P-201ENST00000481676 295 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 AC004893.2-203ENST00000482799 796 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 PKMP4-201ENST00000523134 306 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 ABHD17C-205ENST00000560609 627 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 AC116914.2-201ENST00000571741 291 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 AC018697.1-201ENST00000577354 472 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 GACAT2-201ENST00000579368 818 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 AC121320.1-201ENST00000580975 839 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 SNRPD2-203ENST00000585392 379 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 TMEM205-204ENST00000586218 593 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 SIGLEC21P-201ENST00000598990 1010 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 BNIP3P20-201ENST00000604827 578 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 Metazoa_SRP.152-201ENST00000614413 286 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 AC079779.4-201ENST00000619113 548 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 AC090061.1-201ENST00000500695 1733 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 EDARADD-202ENST00000359362 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 SLC4A11-201ENST00000380056 3094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 SNU13-201ENST00000215956 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 RCL1-206ENST00000442869 1644 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 METTL13-201ENST00000361735 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 IMPDH1P10-201ENST00000440965 1542 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 AOC3-201ENST00000308423 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 SLITRK3-201ENST00000241274 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 ZNF619-209ENST00000521353 1869 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 TP53I11-220ENST00000533940 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 DPY19L2P1-202ENST00000454445 2909 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 TRIM37-201ENST00000262294 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 CAMK2B-201ENST00000258682 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 IL17RB-201ENST00000288167 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 ZFP1-203ENST00000464850 3067 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 VSTM2A-201ENST00000302287 3401 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 ACSF3-218ENST00000614302 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 PAX6-207ENST00000379129 2614 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 ZC2HC1C-203ENST00000524913 4283 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 HDC-202ENST00000543581 2180 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 ATP13A2-201ENST00000326735 3840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 PCDHB2-201ENST00000194155 4126 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 SLC36A1-211ENST00000616007 1389 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 GP2-202ENST00000341642 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 AC010210.1-201ENST00000502521 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 ALAS1-201ENST00000310271 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 AK6-202ENST00000380822 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 CDC25B-201ENST00000245960 3597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 MIR339-201ENST00000362153 94 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 MIR611-201ENST00000384869 67 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 FTH1P19-201ENST00000402402 528 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 AC074085.2-201ENST00000416734 428 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 APRT-202ENST00000426324 664 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 AC023347.1-201ENST00000435352 604 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 RPL21P135-201ENST00000442539 791 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 AL121894.1-201ENST00000450971 436 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 RN7SL483P-201ENST00000478417 285 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 RN7SL452P-201ENST00000482923 291 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 MRPS27-212ENST00000522095 504 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 ZNF503-AS1-202ENST00000524517 790 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 AP006437.2-201ENST00000528000 345 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 LINC01029-202ENST00000578833 366 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 AC125494.1-202ENST00000586338 723 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 PRKACA-208ENST00000589994 1127 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 CDX2-201ENST00000381020 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 ZNF772-209ENST00000615214 1506 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 DCBLD2-202ENST00000326857 3959 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms