Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 SMU1-201ENST00000397149 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 MED22-210ENST00000614493 3886 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 SH3TC2-211ENST00000512049 4002 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 SLC26A2-201ENST00000286298 8080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 IP6K2-210ENST00000431721 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 SLC12A4-204ENST00000541864 3627 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 ATG9A-202ENST00000396761 3799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 USP3-202ENST00000380324 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 MOG-218ENST00000376894 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 LPIN3-201ENST00000373257 4363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 USP24-201ENST00000294383 10549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 PIAS3-203ENST00000393045 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 MAP1A-201ENST00000300231 10258 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 FITM2-201ENST00000396825 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 SP3-201ENST00000310015 6359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 ZNF19-205ENST00000564230 2205 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 TFIP11-203ENST00000407431 2974 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 BOLL-202ENST00000321801 3135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 AC010307.3-202ENST00000515122 3142 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 ZNF550-201ENST00000325134 4305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 ALDH1L1-201ENST00000273450 3179 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 DNM1P35-201ENST00000501931 3188 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 SETD4-201ENST00000332131 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 P4HA2-204ENST00000379100 2563 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 P4HA2-205ENST00000379104 2569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 BICRAL-203ENST00000614467 6510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 EIF4E3-205ENST00000448225 6209 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 HYLS1-201ENST00000356438 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 EPHA5-205ENST00000613740 8355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 MPO-201ENST00000225275 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 SUFU-203ENST00000423559 2601 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 SRSF7-209ENST00000446327 2453 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 NEFM-201ENST00000221166 4020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 AC093642.2-201ENST00000625132 4805 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 E2F8-202ENST00000527884 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 RPH3A-201ENST00000389385 4679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 CHRDL2-201ENST00000263671 1712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 TBATA-201ENST00000299290 1583 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 TBATA-203ENST00000456372 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 POLR2J2-203ENST00000476151 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 MGLL-202ENST00000398101 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 ITGAX-203ENST00000562522 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 COPA-201ENST00000241704 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 TCEAL9-201ENST00000372656 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 TCEAL9-202ENST00000372661 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 RPE-208ENST00000436630 1128 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 AP003392.3-201ENST00000531886 667 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 SLC12A4-203ENST00000537830 3525 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 LINC01898-201ENST00000564156 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 JAK1-201ENST00000342505 5047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 THAP12P2-201ENST00000489193 2267 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 PAQR7-201ENST00000374296 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 OASL-202ENST00000339275 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 ITGA7-203ENST00000452168 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 WDR59-223ENST00000616369 1953 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 MC1R-203ENST00000555427 3637 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 ZNF177-201ENST00000343499 1835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 SLC22A8-202ENST00000336232 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 SLC7A8-204ENST00000422941 3018 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 IL7-210ENST00000541183 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 ALAS1-205ENST00000484952 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 LRAT-201ENST00000336356 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 ZNF619-202ENST00000429348 4104 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 SERPINB8-209ENST00000636430 1719 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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