Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6G9

DYNC1LI1, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms