Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F8

CDY1, Testis-specific chromodomain protein Y 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDY1Q9Y6F8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDY1Q9Y6F8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDY1Q9Y6F8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms