Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y9

SCN10A, Sodium channel protein type 10 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN10AQ9Y5Y9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCN10AQ9Y5Y9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCN10AQ9Y5Y9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCN10AQ9Y5Y9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCN10AQ9Y5Y9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCN10AQ9Y5Y9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCN10AQ9Y5Y9 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
SCN10AQ9Y5Y9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCN10AQ9Y5Y9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCN10AQ9Y5Y9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCN10AQ9Y5Y9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCN10AQ9Y5Y9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCN10AQ9Y5Y9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SCN10AQ9Y5Y9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCN10AQ9Y5Y9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCN10AQ9Y5Y9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCN10AQ9Y5Y9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCN10AQ9Y5Y9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCN10AQ9Y5Y9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCN10AQ9Y5Y9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCN10AQ9Y5Y9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCN10AQ9Y5Y9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCN10AQ9Y5Y9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCN10AQ9Y5Y9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCN10AQ9Y5Y9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCN10AQ9Y5Y9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCN10AQ9Y5Y9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCN10AQ9Y5Y9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCN10AQ9Y5Y9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCN10AQ9Y5Y9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCN10AQ9Y5Y9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCN10AQ9Y5Y9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCN10AQ9Y5Y9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SCN10AQ9Y5Y9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCN10AQ9Y5Y9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCN10AQ9Y5Y9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCN10AQ9Y5Y9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCN10AQ9Y5Y9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCN10AQ9Y5Y9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCN10AQ9Y5Y9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCN10AQ9Y5Y9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCN10AQ9Y5Y9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCN10AQ9Y5Y9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN10AQ9Y5Y9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN10AQ9Y5Y9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN10AQ9Y5Y9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN10AQ9Y5Y9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN10AQ9Y5Y9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN10AQ9Y5Y9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN10AQ9Y5Y9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN10AQ9Y5Y9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN10AQ9Y5Y9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN10AQ9Y5Y9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN10AQ9Y5Y9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN10AQ9Y5Y9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN10AQ9Y5Y9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN10AQ9Y5Y9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN10AQ9Y5Y9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN10AQ9Y5Y9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN10AQ9Y5Y9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN10AQ9Y5Y9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN10AQ9Y5Y9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN10AQ9Y5Y9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN10AQ9Y5Y9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN10AQ9Y5Y9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN10AQ9Y5Y9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN10AQ9Y5Y9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN10AQ9Y5Y9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN10AQ9Y5Y9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN10AQ9Y5Y9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCN10AQ9Y5Y9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCN10AQ9Y5Y9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCN10AQ9Y5Y9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCN10AQ9Y5Y9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCN10AQ9Y5Y9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCN10AQ9Y5Y9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCN10AQ9Y5Y9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCN10AQ9Y5Y9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCN10AQ9Y5Y9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCN10AQ9Y5Y9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCN10AQ9Y5Y9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN10AQ9Y5Y9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN10AQ9Y5Y9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN10AQ9Y5Y9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN10AQ9Y5Y9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN10AQ9Y5Y9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN10AQ9Y5Y9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN10AQ9Y5Y9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN10AQ9Y5Y9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN10AQ9Y5Y9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN10AQ9Y5Y9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN10AQ9Y5Y9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN10AQ9Y5Y9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN10AQ9Y5Y9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN10AQ9Y5Y9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN10AQ9Y5Y9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN10AQ9Y5Y9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN10AQ9Y5Y9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN10AQ9Y5Y9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN10AQ9Y5Y9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms