Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P3

RAI2, Retinoic acid-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAI2Q9Y5P3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAI2Q9Y5P3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms