Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J7

TIMM9, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim9, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM9Q9Y5J7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TIMM9Q9Y5J7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TIMM9Q9Y5J7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TIMM9Q9Y5J7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TIMM9Q9Y5J7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TIMM9Q9Y5J7 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TIMM9Q9Y5J7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TIMM9Q9Y5J7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TIMM9Q9Y5J7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TIMM9Q9Y5J7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TIMM9Q9Y5J7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TIMM9Q9Y5J7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TIMM9Q9Y5J7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TIMM9Q9Y5J7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TIMM9Q9Y5J7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TIMM9Q9Y5J7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TIMM9Q9Y5J7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TIMM9Q9Y5J7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TIMM9Q9Y5J7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TIMM9Q9Y5J7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TIMM9Q9Y5J7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TIMM9Q9Y5J7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TIMM9Q9Y5J7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TIMM9Q9Y5J7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TIMM9Q9Y5J7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TIMM9Q9Y5J7 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TIMM9Q9Y5J7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TIMM9Q9Y5J7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TIMM9Q9Y5J7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TIMM9Q9Y5J7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TIMM9Q9Y5J7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TIMM9Q9Y5J7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TIMM9Q9Y5J7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TIMM9Q9Y5J7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TIMM9Q9Y5J7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TIMM9Q9Y5J7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TIMM9Q9Y5J7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TIMM9Q9Y5J7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TIMM9Q9Y5J7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TIMM9Q9Y5J7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TIMM9Q9Y5J7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TIMM9Q9Y5J7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TIMM9Q9Y5J7 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TIMM9Q9Y5J7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TIMM9Q9Y5J7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TIMM9Q9Y5J7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TIMM9Q9Y5J7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TIMM9Q9Y5J7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TIMM9Q9Y5J7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TIMM9Q9Y5J7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TIMM9Q9Y5J7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TIMM9Q9Y5J7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TIMM9Q9Y5J7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TIMM9Q9Y5J7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TIMM9Q9Y5J7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TIMM9Q9Y5J7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TIMM9Q9Y5J7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TIMM9Q9Y5J7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TIMM9Q9Y5J7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TIMM9Q9Y5J7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TIMM9Q9Y5J7 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TIMM9Q9Y5J7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TIMM9Q9Y5J7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TIMM9Q9Y5J7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TIMM9Q9Y5J7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TIMM9Q9Y5J7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TIMM9Q9Y5J7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TIMM9Q9Y5J7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TIMM9Q9Y5J7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TIMM9Q9Y5J7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TIMM9Q9Y5J7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TIMM9Q9Y5J7 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TIMM9Q9Y5J7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TIMM9Q9Y5J7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TIMM9Q9Y5J7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TIMM9Q9Y5J7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TIMM9Q9Y5J7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TIMM9Q9Y5J7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TIMM9Q9Y5J7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TIMM9Q9Y5J7 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TIMM9Q9Y5J7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TIMM9Q9Y5J7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TIMM9Q9Y5J7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TIMM9Q9Y5J7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TIMM9Q9Y5J7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TIMM9Q9Y5J7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TIMM9Q9Y5J7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TIMM9Q9Y5J7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TIMM9Q9Y5J7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TIMM9Q9Y5J7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TIMM9Q9Y5J7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TIMM9Q9Y5J7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TIMM9Q9Y5J7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TIMM9Q9Y5J7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TIMM9Q9Y5J7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TIMM9Q9Y5J7 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TIMM9Q9Y5J7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TIMM9Q9Y5J7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TIMM9Q9Y5J7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TIMM9Q9Y5J7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms