Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B5

MTCL1, Microtubule cross-linking factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTCL1Q9Y4B5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTCL1Q9Y4B5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTCL1Q9Y4B5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTCL1Q9Y4B5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTCL1Q9Y4B5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTCL1Q9Y4B5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTCL1Q9Y4B5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTCL1Q9Y4B5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTCL1Q9Y4B5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTCL1Q9Y4B5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTCL1Q9Y4B5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTCL1Q9Y4B5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTCL1Q9Y4B5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTCL1Q9Y4B5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTCL1Q9Y4B5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTCL1Q9Y4B5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTCL1Q9Y4B5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTCL1Q9Y4B5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTCL1Q9Y4B5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTCL1Q9Y4B5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTCL1Q9Y4B5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTCL1Q9Y4B5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTCL1Q9Y4B5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MTCL1Q9Y4B5 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTCL1Q9Y4B5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTCL1Q9Y4B5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTCL1Q9Y4B5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTCL1Q9Y4B5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTCL1Q9Y4B5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTCL1Q9Y4B5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTCL1Q9Y4B5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTCL1Q9Y4B5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTCL1Q9Y4B5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTCL1Q9Y4B5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTCL1Q9Y4B5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MTCL1Q9Y4B5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTCL1Q9Y4B5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTCL1Q9Y4B5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTCL1Q9Y4B5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MTCL1Q9Y4B5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MTCL1Q9Y4B5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTCL1Q9Y4B5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTCL1Q9Y4B5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTCL1Q9Y4B5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTCL1Q9Y4B5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTCL1Q9Y4B5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MTCL1Q9Y4B5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MTCL1Q9Y4B5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTCL1Q9Y4B5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTCL1Q9Y4B5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTCL1Q9Y4B5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTCL1Q9Y4B5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTCL1Q9Y4B5 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTCL1Q9Y4B5 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTCL1Q9Y4B5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTCL1Q9Y4B5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTCL1Q9Y4B5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MTCL1Q9Y4B5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTCL1Q9Y4B5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTCL1Q9Y4B5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTCL1Q9Y4B5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTCL1Q9Y4B5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTCL1Q9Y4B5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MTCL1Q9Y4B5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTCL1Q9Y4B5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTCL1Q9Y4B5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTCL1Q9Y4B5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTCL1Q9Y4B5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTCL1Q9Y4B5 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTCL1Q9Y4B5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTCL1Q9Y4B5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTCL1Q9Y4B5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTCL1Q9Y4B5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTCL1Q9Y4B5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTCL1Q9Y4B5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTCL1Q9Y4B5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTCL1Q9Y4B5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTCL1Q9Y4B5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTCL1Q9Y4B5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTCL1Q9Y4B5 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MTCL1Q9Y4B5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTCL1Q9Y4B5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTCL1Q9Y4B5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTCL1Q9Y4B5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTCL1Q9Y4B5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTCL1Q9Y4B5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTCL1Q9Y4B5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTCL1Q9Y4B5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTCL1Q9Y4B5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MTCL1Q9Y4B5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTCL1Q9Y4B5 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MTCL1Q9Y4B5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTCL1Q9Y4B5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTCL1Q9Y4B5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTCL1Q9Y4B5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTCL1Q9Y4B5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTCL1Q9Y4B5 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTCL1Q9Y4B5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTCL1Q9Y4B5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTCL1Q9Y4B5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms