Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HCN4Q9Y3Q4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HCN4Q9Y3Q4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms