Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y343

SNX24, Sorting nexin-24, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX24Q9Y343 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
SNX24Q9Y343 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX24Q9Y343 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX24Q9Y343 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX24Q9Y343 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX24Q9Y343 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX24Q9Y343 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX24Q9Y343 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX24Q9Y343 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX24Q9Y343 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX24Q9Y343 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX24Q9Y343 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX24Q9Y343 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX24Q9Y343 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX24Q9Y343 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX24Q9Y343 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX24Q9Y343 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX24Q9Y343 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX24Q9Y343 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX24Q9Y343 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX24Q9Y343 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX24Q9Y343 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX24Q9Y343 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX24Q9Y343 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX24Q9Y343 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX24Q9Y343 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX24Q9Y343 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX24Q9Y343 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX24Q9Y343 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX24Q9Y343 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX24Q9Y343 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX24Q9Y343 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX24Q9Y343 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX24Q9Y343 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX24Q9Y343 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX24Q9Y343 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX24Q9Y343 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX24Q9Y343 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX24Q9Y343 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX24Q9Y343 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX24Q9Y343 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX24Q9Y343 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX24Q9Y343 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX24Q9Y343 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX24Q9Y343 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX24Q9Y343 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX24Q9Y343 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX24Q9Y343 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX24Q9Y343 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX24Q9Y343 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX24Q9Y343 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX24Q9Y343 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX24Q9Y343 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX24Q9Y343 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX24Q9Y343 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX24Q9Y343 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX24Q9Y343 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX24Q9Y343 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX24Q9Y343 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX24Q9Y343 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX24Q9Y343 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX24Q9Y343 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX24Q9Y343 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX24Q9Y343 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX24Q9Y343 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX24Q9Y343 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX24Q9Y343 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX24Q9Y343 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX24Q9Y343 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX24Q9Y343 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX24Q9Y343 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX24Q9Y343 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX24Q9Y343 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX24Q9Y343 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms