Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X8

UBE2D4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D4, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D4Q9Y2X8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2D4Q9Y2X8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2D4Q9Y2X8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2D4Q9Y2X8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2D4Q9Y2X8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2D4Q9Y2X8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2D4Q9Y2X8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2D4Q9Y2X8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2D4Q9Y2X8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2D4Q9Y2X8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2D4Q9Y2X8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2D4Q9Y2X8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2D4Q9Y2X8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2D4Q9Y2X8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2D4Q9Y2X8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2D4Q9Y2X8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2D4Q9Y2X8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2D4Q9Y2X8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2D4Q9Y2X8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2D4Q9Y2X8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2D4Q9Y2X8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2D4Q9Y2X8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2D4Q9Y2X8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2D4Q9Y2X8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UBE2D4Q9Y2X8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2D4Q9Y2X8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2D4Q9Y2X8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms