Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U9

KLHDC2, Kelch domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC2Q9Y2U9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHDC2Q9Y2U9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHDC2Q9Y2U9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHDC2Q9Y2U9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHDC2Q9Y2U9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHDC2Q9Y2U9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms