Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T7

YBX2, Y-box-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX2Q9Y2T7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
YBX2Q9Y2T7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
YBX2Q9Y2T7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
YBX2Q9Y2T7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
YBX2Q9Y2T7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
YBX2Q9Y2T7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
YBX2Q9Y2T7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
YBX2Q9Y2T7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
YBX2Q9Y2T7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
YBX2Q9Y2T7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
YBX2Q9Y2T7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
YBX2Q9Y2T7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YBX2Q9Y2T7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YBX2Q9Y2T7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YBX2Q9Y2T7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YBX2Q9Y2T7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YBX2Q9Y2T7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
YBX2Q9Y2T7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YBX2Q9Y2T7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
YBX2Q9Y2T7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YBX2Q9Y2T7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
YBX2Q9Y2T7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
YBX2Q9Y2T7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
YBX2Q9Y2T7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
YBX2Q9Y2T7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YBX2Q9Y2T7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YBX2Q9Y2T7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
YBX2Q9Y2T7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
YBX2Q9Y2T7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
YBX2Q9Y2T7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
YBX2Q9Y2T7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
YBX2Q9Y2T7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
YBX2Q9Y2T7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
YBX2Q9Y2T7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
YBX2Q9Y2T7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
YBX2Q9Y2T7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
YBX2Q9Y2T7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
YBX2Q9Y2T7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
YBX2Q9Y2T7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
YBX2Q9Y2T7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
YBX2Q9Y2T7 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
YBX2Q9Y2T7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
YBX2Q9Y2T7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
YBX2Q9Y2T7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
YBX2Q9Y2T7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
YBX2Q9Y2T7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
YBX2Q9Y2T7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
YBX2Q9Y2T7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
YBX2Q9Y2T7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
YBX2Q9Y2T7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
YBX2Q9Y2T7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
YBX2Q9Y2T7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
YBX2Q9Y2T7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
YBX2Q9Y2T7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
YBX2Q9Y2T7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
YBX2Q9Y2T7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
YBX2Q9Y2T7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
YBX2Q9Y2T7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
YBX2Q9Y2T7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
YBX2Q9Y2T7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
YBX2Q9Y2T7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
YBX2Q9Y2T7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
YBX2Q9Y2T7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
YBX2Q9Y2T7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
YBX2Q9Y2T7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
YBX2Q9Y2T7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
YBX2Q9Y2T7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
YBX2Q9Y2T7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
YBX2Q9Y2T7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
YBX2Q9Y2T7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
YBX2Q9Y2T7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
YBX2Q9Y2T7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
YBX2Q9Y2T7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
YBX2Q9Y2T7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
YBX2Q9Y2T7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
YBX2Q9Y2T7 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
YBX2Q9Y2T7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
YBX2Q9Y2T7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
YBX2Q9Y2T7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
YBX2Q9Y2T7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
YBX2Q9Y2T7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
YBX2Q9Y2T7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
YBX2Q9Y2T7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
YBX2Q9Y2T7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
YBX2Q9Y2T7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
YBX2Q9Y2T7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
YBX2Q9Y2T7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
YBX2Q9Y2T7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
YBX2Q9Y2T7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
YBX2Q9Y2T7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
YBX2Q9Y2T7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
YBX2Q9Y2T7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
YBX2Q9Y2T7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
YBX2Q9Y2T7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
YBX2Q9Y2T7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
YBX2Q9Y2T7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
YBX2Q9Y2T7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
YBX2Q9Y2T7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
YBX2Q9Y2T7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
YBX2Q9Y2T7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms