Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX6

KIAA1024, UPF0258 protein KIAA1024, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1024Q9UPX6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KIAA1024Q9UPX6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KIAA1024Q9UPX6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KIAA1024Q9UPX6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KIAA1024Q9UPX6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KIAA1024Q9UPX6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KIAA1024Q9UPX6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KIAA1024Q9UPX6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KIAA1024Q9UPX6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KIAA1024Q9UPX6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KIAA1024Q9UPX6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KIAA1024Q9UPX6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KIAA1024Q9UPX6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KIAA1024Q9UPX6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KIAA1024Q9UPX6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KIAA1024Q9UPX6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KIAA1024Q9UPX6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIAA1024Q9UPX6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIAA1024Q9UPX6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KIAA1024Q9UPX6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIAA1024Q9UPX6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIAA1024Q9UPX6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIAA1024Q9UPX6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIAA1024Q9UPX6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIAA1024Q9UPX6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIAA1024Q9UPX6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIAA1024Q9UPX6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIAA1024Q9UPX6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIAA1024Q9UPX6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIAA1024Q9UPX6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIAA1024Q9UPX6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIAA1024Q9UPX6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIAA1024Q9UPX6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIAA1024Q9UPX6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIAA1024Q9UPX6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIAA1024Q9UPX6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIAA1024Q9UPX6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIAA1024Q9UPX6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIAA1024Q9UPX6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIAA1024Q9UPX6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIAA1024Q9UPX6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIAA1024Q9UPX6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIAA1024Q9UPX6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIAA1024Q9UPX6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIAA1024Q9UPX6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms