Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX7Q9UNH6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX7Q9UNH6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX7Q9UNH6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX7Q9UNH6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX7Q9UNH6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX7Q9UNH6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX7Q9UNH6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX7Q9UNH6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX7Q9UNH6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX7Q9UNH6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX7Q9UNH6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX7Q9UNH6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX7Q9UNH6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX7Q9UNH6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX7Q9UNH6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX7Q9UNH6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX7Q9UNH6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX7Q9UNH6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX7Q9UNH6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX7Q9UNH6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX7Q9UNH6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX7Q9UNH6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX7Q9UNH6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms