Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCML1Q9UN30 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCML1Q9UN30 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCML1Q9UN30 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCML1Q9UN30 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCML1Q9UN30 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCML1Q9UN30 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCML1Q9UN30 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCML1Q9UN30 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCML1Q9UN30 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCML1Q9UN30 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCML1Q9UN30 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCML1Q9UN30 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCML1Q9UN30 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SCML1Q9UN30 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCML1Q9UN30 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCML1Q9UN30 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCML1Q9UN30 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCML1Q9UN30 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCML1Q9UN30 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCML1Q9UN30 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SCML1Q9UN30 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCML1Q9UN30 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCML1Q9UN30 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCML1Q9UN30 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCML1Q9UN30 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCML1Q9UN30 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCML1Q9UN30 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCML1Q9UN30 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCML1Q9UN30 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCML1Q9UN30 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCML1Q9UN30 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SCML1Q9UN30 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCML1Q9UN30 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCML1Q9UN30 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCML1Q9UN30 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCML1Q9UN30 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCML1Q9UN30 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCML1Q9UN30 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCML1Q9UN30 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCML1Q9UN30 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCML1Q9UN30 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCML1Q9UN30 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCML1Q9UN30 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SCML1Q9UN30 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCML1Q9UN30 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCML1Q9UN30 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCML1Q9UN30 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCML1Q9UN30 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCML1Q9UN30 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SCML1Q9UN30 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCML1Q9UN30 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCML1Q9UN30 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SCML1Q9UN30 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCML1Q9UN30 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCML1Q9UN30 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCML1Q9UN30 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCML1Q9UN30 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCML1Q9UN30 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCML1Q9UN30 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCML1Q9UN30 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCML1Q9UN30 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCML1Q9UN30 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCML1Q9UN30 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCML1Q9UN30 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCML1Q9UN30 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCML1Q9UN30 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCML1Q9UN30 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCML1Q9UN30 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCML1Q9UN30 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCML1Q9UN30 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCML1Q9UN30 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCML1Q9UN30 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCML1Q9UN30 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCML1Q9UN30 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCML1Q9UN30 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCML1Q9UN30 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCML1Q9UN30 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCML1Q9UN30 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCML1Q9UN30 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCML1Q9UN30 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCML1Q9UN30 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCML1Q9UN30 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCML1Q9UN30 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCML1Q9UN30 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCML1Q9UN30 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCML1Q9UN30 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCML1Q9UN30 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCML1Q9UN30 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCML1Q9UN30 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SCML1Q9UN30 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCML1Q9UN30 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SCML1Q9UN30 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCML1Q9UN30 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCML1Q9UN30 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCML1Q9UN30 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCML1Q9UN30 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCML1Q9UN30 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCML1Q9UN30 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCML1Q9UN30 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms