Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS5

PHTF1, Putative homeodomain transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 762 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF1Q9UMS5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHTF1Q9UMS5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms