Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ3

BARX2, Homeobox protein BarH-like 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARX2Q9UMQ3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BARX2Q9UMQ3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BARX2Q9UMQ3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms