Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PNMA8BQ9ULN7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
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