Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKQ2

ADAM28, Disintegrin and metalloproteinase domain-containing protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ADAM28Q9UKQ2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ADAM28Q9UKQ2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ADAM28Q9UKQ2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ADAM28Q9UKQ2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ADAM28Q9UKQ2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ADAM28Q9UKQ2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ADAM28Q9UKQ2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ADAM28Q9UKQ2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ADAM28Q9UKQ2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ADAM28Q9UKQ2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ADAM28Q9UKQ2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ADAM28Q9UKQ2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ADAM28Q9UKQ2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ADAM28Q9UKQ2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ADAM28Q9UKQ2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ADAM28Q9UKQ2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ADAM28Q9UKQ2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ADAM28Q9UKQ2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ADAM28Q9UKQ2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ADAM28Q9UKQ2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ADAM28Q9UKQ2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ADAM28Q9UKQ2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ADAM28Q9UKQ2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ADAM28Q9UKQ2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ADAM28Q9UKQ2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ADAM28Q9UKQ2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ADAM28Q9UKQ2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ADAM28Q9UKQ2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ADAM28Q9UKQ2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ADAM28Q9UKQ2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ADAM28Q9UKQ2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ADAM28Q9UKQ2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ADAM28Q9UKQ2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ADAM28Q9UKQ2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ADAM28Q9UKQ2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ADAM28Q9UKQ2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ADAM28Q9UKQ2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ADAM28Q9UKQ2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ADAM28Q9UKQ2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ADAM28Q9UKQ2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ADAM28Q9UKQ2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ADAM28Q9UKQ2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ADAM28Q9UKQ2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ADAM28Q9UKQ2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ADAM28Q9UKQ2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ADAM28Q9UKQ2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ADAM28Q9UKQ2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ADAM28Q9UKQ2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ADAM28Q9UKQ2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ADAM28Q9UKQ2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ADAM28Q9UKQ2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ADAM28Q9UKQ2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ADAM28Q9UKQ2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ADAM28Q9UKQ2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ADAM28Q9UKQ2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ADAM28Q9UKQ2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ADAM28Q9UKQ2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ADAM28Q9UKQ2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ADAM28Q9UKQ2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ADAM28Q9UKQ2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ADAM28Q9UKQ2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ADAM28Q9UKQ2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ADAM28Q9UKQ2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ADAM28Q9UKQ2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ADAM28Q9UKQ2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ADAM28Q9UKQ2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ADAM28Q9UKQ2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ADAM28Q9UKQ2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ADAM28Q9UKQ2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ADAM28Q9UKQ2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ADAM28Q9UKQ2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ADAM28Q9UKQ2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ADAM28Q9UKQ2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ADAM28Q9UKQ2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ADAM28Q9UKQ2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ADAM28Q9UKQ2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ADAM28Q9UKQ2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ADAM28Q9UKQ2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ADAM28Q9UKQ2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ADAM28Q9UKQ2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ADAM28Q9UKQ2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ADAM28Q9UKQ2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ADAM28Q9UKQ2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ADAM28Q9UKQ2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ADAM28Q9UKQ2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ADAM28Q9UKQ2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ADAM28Q9UKQ2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ADAM28Q9UKQ2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ADAM28Q9UKQ2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ADAM28Q9UKQ2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ADAM28Q9UKQ2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ADAM28Q9UKQ2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ADAM28Q9UKQ2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ADAM28Q9UKQ2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ADAM28Q9UKQ2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ADAM28Q9UKQ2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ADAM28Q9UKQ2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ADAM28Q9UKQ2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ADAM28Q9UKQ2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ADAM28Q9UKQ2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms