Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW3

DNMT3L, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3LQ9UJW3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms