Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP25Q9UHP3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP25Q9UHP3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP25Q9UHP3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP25Q9UHP3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP25Q9UHP3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP25Q9UHP3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP25Q9UHP3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP25Q9UHP3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP25Q9UHP3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP25Q9UHP3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP25Q9UHP3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP25Q9UHP3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP25Q9UHP3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP25Q9UHP3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP25Q9UHP3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP25Q9UHP3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP25Q9UHP3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP25Q9UHP3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP25Q9UHP3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP25Q9UHP3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
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