Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHM6

OPN4, Melanopsin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN4Q9UHM6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms