Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DNMT3BQ9UBC3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.5 ms