Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K3

RCOR3, REST corepressor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCOR3Q9P2K3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RCOR3Q9P2K3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RCOR3Q9P2K3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms