Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0S2

COX16, Cytochrome c oxidase assembly protein COX16 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX16Q9P0S2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
COX16Q9P0S2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COX16Q9P0S2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COX16Q9P0S2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COX16Q9P0S2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COX16Q9P0S2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COX16Q9P0S2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
COX16Q9P0S2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms