Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZV6

MSRB1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB1Q9NZV6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MSRB1Q9NZV6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms