Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA3

GOLGA6A, Golgin subfamily A member 6A, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6AQ9NYA3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA6AQ9NYA3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA6AQ9NYA3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GOLGA6AQ9NYA3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GOLGA6AQ9NYA3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLGA6AQ9NYA3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GOLGA6AQ9NYA3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GOLGA6AQ9NYA3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.5 ms