Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY91

SLC5A4, Solute carrier family 5 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A4Q9NY91 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC5A4Q9NY91 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC5A4Q9NY91 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC5A4Q9NY91 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC5A4Q9NY91 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC5A4Q9NY91 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC5A4Q9NY91 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC5A4Q9NY91 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC5A4Q9NY91 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC5A4Q9NY91 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC5A4Q9NY91 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC5A4Q9NY91 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC5A4Q9NY91 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC5A4Q9NY91 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC5A4Q9NY91 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC5A4Q9NY91 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC5A4Q9NY91 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC5A4Q9NY91 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC5A4Q9NY91 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC5A4Q9NY91 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC5A4Q9NY91 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC5A4Q9NY91 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC5A4Q9NY91 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC5A4Q9NY91 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC5A4Q9NY91 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC5A4Q9NY91 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC5A4Q9NY91 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC5A4Q9NY91 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC5A4Q9NY91 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC5A4Q9NY91 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC5A4Q9NY91 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC5A4Q9NY91 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC5A4Q9NY91 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC5A4Q9NY91 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC5A4Q9NY91 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC5A4Q9NY91 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC5A4Q9NY91 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC5A4Q9NY91 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC5A4Q9NY91 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC5A4Q9NY91 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC5A4Q9NY91 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC5A4Q9NY91 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC5A4Q9NY91 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC5A4Q9NY91 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC5A4Q9NY91 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC5A4Q9NY91 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC5A4Q9NY91 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC5A4Q9NY91 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC5A4Q9NY91 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC5A4Q9NY91 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC5A4Q9NY91 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC5A4Q9NY91 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC5A4Q9NY91 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC5A4Q9NY91 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC5A4Q9NY91 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC5A4Q9NY91 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC5A4Q9NY91 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC5A4Q9NY91 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC5A4Q9NY91 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC5A4Q9NY91 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC5A4Q9NY91 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC5A4Q9NY91 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC5A4Q9NY91 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC5A4Q9NY91 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC5A4Q9NY91 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC5A4Q9NY91 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC5A4Q9NY91 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC5A4Q9NY91 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC5A4Q9NY91 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC5A4Q9NY91 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC5A4Q9NY91 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC5A4Q9NY91 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC5A4Q9NY91 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC5A4Q9NY91 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC5A4Q9NY91 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC5A4Q9NY91 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC5A4Q9NY91 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC5A4Q9NY91 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC5A4Q9NY91 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC5A4Q9NY91 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC5A4Q9NY91 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC5A4Q9NY91 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC5A4Q9NY91 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC5A4Q9NY91 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC5A4Q9NY91 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC5A4Q9NY91 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC5A4Q9NY91 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC5A4Q9NY91 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC5A4Q9NY91 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC5A4Q9NY91 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC5A4Q9NY91 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC5A4Q9NY91 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC5A4Q9NY91 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC5A4Q9NY91 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC5A4Q9NY91 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC5A4Q9NY91 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC5A4Q9NY91 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC5A4Q9NY91 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC5A4Q9NY91 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC5A4Q9NY91 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms